Novo método revela alta similaridade entre o cromossoma Y dos Gorilas e o dos humanos

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Um novo, menos dispendioso e mais rápido método foi agora desenvolvido e utilizado para determinar a sequência de DNA do cromossoma Y específico no gorila macho. A técnica permitirá um melhor acesso a informação genética do cromossoma Y de qualquer espécie e portanto poderá ser utilizada para estudar doenças de infertilidade masculina e mutações específicas de sujeitos macho. Poderá também ajudar nos esforços de conservação genética, ajudando a rastrear a paternidade e a controlar como os machos se movem dentro e entre populações de espécies ameaçadas de extinção, como os gorilas.

Um papel descrevendo o método e a descoberta resultante de seu uso em comparar a seqüência do cromossoma Y de gorila para as seqüências do ser humano e chimpanzé Y cromossomos será publicado na edição Online do avanço do periódico Genome Research em 2 de março de 2016. O artigo também será publicado na edição de abril de 2016 impressão do jornal.

O cromossomo Y de mamíferos é incrivelmente difícil de sequência para um número de razões. Uma razão é que o cromossomo Y está presente em apenas uma cópia e torna-se apenas cerca de um a dois por cento do total material genético encontrado em uma célula de um macho. Para reduzir essa dificuldade, os pesquisadores usaram uma técnica experimental chamada fluxo-classificação para selecionar preferencialmente o cromossomo Y para seqüenciamento baseado no tamanho e conteúdo genético do cromossomo.

O cromossomo Y, como todo o ADN, é composto de uma série de moléculas chamadas "bases" são representados por letras A, T, C e G. corrente tecnologias de sequenciamento genético produzem "leituras" da sequência que são muito mais curtas do que o comprimento inteiro do cromossomo. Estas leituras precisam ser colocados em ordem e montadas por encontrar lugares onde eles se sobrepõem em pedaços mais e mais. A equipe de pesquisa usado duas tecnologias diferentes de seqüenciamento para ajudar com esta montagem da sequência de DNA do cromossomo Y.

Uma tecnologia de seqüenciamento, usada pelos pesquisadores produz quantidades maciças de leituras muito curtas — cerca de 150 a 250 bases de comprimento. Usando esse método, os pesquisadores sequenciado suficiente leituras para cobrir todo o comprimento do cromossomo Y cerca de 450 vezes. Os pesquisadores reunidos estas leituras curtas em pedaços mais que eles então ainda mais conectados usando a tecnologia de seqüenciamento segunda que produz leituras mais — cerca de sete mil bases de comprimento em média.

Outro motivo que a determinação da seqüência genética do cromossomo Y é tão difícil é que é composto por um número invulgarmente elevado de seqüências repetidas — regiões onde a seqüência de como, Ts, Cs e Gs são idênticos ou quase idênticos, para milhares ou milhões de bases em uma fileira. Muitos destes se repete, incluindo alguns genes, aparecem como séries consecutivas da mesma sequência repetida ou como palindromes longos que, como a palavra "carro de corrida," ler o mesmo para a frente e para trás. Os pesquisadores usaram uma técnica experimental — "gota digital polymerase chain reaction" — para determinar o número de cópias de genes que aparecem nestas séries.

Para demonstrar a utilidade do gorila seqüência de cromossomo Y eles gerados, os pesquisadores projetado marcadores genéticos que podem ser usados para diferenciar o parentesco genético entre gorilas machos e, portanto, para ajudar nos esforços de conservação genética visados preservar esta espécie ameaçada.

[PHYS.org]

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